Jaarlijks organiseert één van de metabole centra het meerdaagse ESN-voorjaarscongres. Dit congres biedt een waardevol platform voor kennisuitwisseling, wetenschappelijke verdieping en ontmoeting. Er is volop ruimte voor zowel ervaren onderzoekers als jonge onderzoekers om hun onderzoeksresultaten en nieuwe inzichten te presenteren.
Tijdens het voorjaarscongres worden tevens verschillende jaarlijkse prijzen en stimuleringsbeurzen uitgereikt. Het gaat om de Wadman-Van Gennip Award: de prijs voor het beste proefschrift en de prijs voor het Beste Abstract. Met de stimuleringsbeurzen wil ESN jonge en veelbelovende onderzoekers ondersteunen in hun verdere ontwikkeling binnen het vakgebied.
Naast het voorjaarscongres, met daarin opgenomen de ALV, wordt er jaarlijks een najaarscongres georganiseerd, en draagt de Scholingscommissie bij aan de verdere deskundigheidsbevordering binnen het vakgebied. Zij organiseert de Cursus Metabole Ziekten, gericht op actuele ontwikkelingen en verdieping van kennis en expertise.